Анализ пространственной структуры белков в терминах матриц остаток-остаточных контактов. III. Сродство остатков

Abstract

Обсуждена возможность определения взаимного сродства аминокислотных остатков с помощью описания трехмерной структуры белков в терминах матриц остаток-остаточных контактов. Проверена нулевая гипотеза об отсутствии сродства между аминокислотными остатками; значения соответствующих элементов совокупных матриц остаток-остаточных контактов в 91% случаях не показали статистически значимых отличий от нулевой гипотезы. В 9% случаев нулевая гипотеза была отвергнута, что позволило выявить закономерность для остатков с заряженными боковыми группами, особенно в случае противоположно заряженных боковых групп.