Использование однородной семантической сети для классификации результатов генетического анализа

Abstract

В работе показано использование механизма сравнения семантических сетей текстов в задаче диагностики заболеваний с использованием сигнальных сетей. Выявление степени пересечения семантических сетей текстов позволяет говорить о степени их смыслового подобия. Однородная семантическая сеть как множество узлов, связанных дугами, имеет численные характеристики – частоты появления слов, а также пар слов в тексте, которые перенормируются с использованием n-граммной модели текста. Такие сети как смысловые портреты текстов могут служить для сравнения (и, следовательно, для классификации) текстов. Генетический квазитекст может быть представлен, в том числе, в виде сигнальной или генной сети. Сигнальные сети разных классов генетических событий могут быть использованы для классификации этих текстов. В этом случае концентрации белков, выявленные в процессе эксперимента, используются для вычисления числовых характеристик узлов сети. Приведены примеры сравнения сетей генетических квазитекстов, соответствующих норме и патологии.